لقد تعرض المنهج العقلي البرهاني على مر التاريخ للجفاء الشديد، ولأشرس حملات التشويه من قبل الناس والمحافل العلمية، ومن قبل الأنظمة الجائرة، حتى تم إقصاوه بالكلية عن الجامعات والمعاهد الدينية وأغلب الحوزات العلمية، واستبداله بالمناهج الكلامية الجدلية والخطابية الظنية، والمسالك الصوفية الخرافية، والطرق الحسية المادية، مما استلزم عواقب وخيمة على المستوى الفكري والثقافي.

إن هذا البحث المختصر محاولة للتفتيش عن العلل والدوافع المختلفة، التي أدت إلى انحسار المنهج العقلي البرهاني في المجتمعات البشرية، لعلنا نستطيع من خلاله أن نصل إلى الحلول الناجعة لعلاج هذه المشاكل، بغية الخروج من هذه المحنة الإنسانية الكبرى.